生
黄连长于清泻疫毒、凉血止血、清热利湿、杀灭虫毒，对热病邪入心经之高热、烦躁、谵妄、昏迷，或热盛迫血妄行之吐血、衄血、咯血、尿血、便血，湿热下注之热淋、血淋、泄泻、痢疾、外阴肿痛、痔疮肿痛出血，以及蛔虫病、百日咳、疥疮和体癣效果明显。常与
大黄、
黄芩、水牛角、
生地黄、冰片、
牡丹皮、
赤芍、
白茅根、
仙鹤草、
小蓟等药配合使用。
炒黄连长于燥湿清热，对湿热中阻之胸闷脘痞，肝胆湿热之黄疸，湿热浸淫肌肤之痈疽疮毒、疔毒走黄、湿疹流注，以及水火烫伤之肌肤溃烂有良好效果。常与
苍术、
黄柏、川
牛膝、
薏苡仁、茵陈、
龙胆草、
金钱草、
苦参等药配合使用。